23 октября 1943 года Указом Президиума Верховного Совета СССР санитарке 1 стрелковой роты 835-го стрелкового полка 237-й стрелковой дивизии Марии Захаровне Щербаченко присвоено звание Героя Советского Союза.

В годы Великой Отечественной войны во время оккупации проживала в селе Неждановка Волчанского уезда Харьковской губернии.
Была призвана в ряды Красной Армии в марте 1943 года. После окончания курсов санитарок при Самаркандском медучилище была в июне 1943 года направлена в действующую армию. Участвовала в боях Великой Отечественной войны.
В ночь на 24 сентября 1943 года санитарка Щербаченко вместе со своим подразделением одной из первых переправилась через реку Днепр в районе села Гребени, расположенного в Кагарлыкском районе Киевской области. За 10 дней она вынесла с поля боя и оказала первую медицинскую помощь 112-и раненым бойцам. Тяжело раненных солдат и офицеров Мария Захаровна лично переправляла через реку до ближайшего медпункта. В первые дни боёв она сражалась в рядах бойцов с автоматом в руках.
23 октября 1943 года указом Президиума Верховного Совета СССР красноармейцу Марии Захаровне Щербаченко было присвоено высокое звание Героя Советского Союза.
После войны старшина Мария Щербаченко была демобилизована. После окончания Ташкентской юридической школы работала юристом.
Приказом министра обороны Украины № 188 от 22 июня 2000 года Мария Захаровна была зачислена почётным солдатом 407-го центрального военного госпиталя Северного оперативного командования.